[résolu]retour chariot et ubuntu sparc

[kmezhoud]

Bonjour Tout le monde,

Le retour chariot a bien marché.
Merci pour votre disponibilité. Je vais essayer de répondre à tout le monde.

OK Hatem, pour le ubuntu sparc. je vais regraver le cd et lire la doc
<http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=677982>. Le batch c'est le ssh
ou csh?
Merci pour ta disponibilité, j'ai bien trouvé la solution dans ubuntu-fr
<http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?pid=2094545#p2094545>
Mais je vais proposer dans qui suit un autre exercice.


Salut Imed, awk a bien marché. J'ai changé fp.awk par le nom de mon
script que tu m'as écrit.

Le output est sur le terminal. j'ai 4000 séquence alors devines ce qui
s'est passé...

Alors je voulais ajouter une ligne pour mettre le tout dans un fichier
mais je n'ai pas réussit.
Je pense que ce n'ai pas compliqué mais je n'ai pas trop tardé dessus.
Il ya  quelqu'un qui a voulu utulisé awk mais il n'a pas réussit. Look
here <http://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?pid=2094545#p2094545>

J'ai rajouté ton script dans le forum ubuntu-fr.


Salut Malek,

talend me semble intéressant. ça marche sur windob?


Bon je passe à une autre étape dans mes traitements des données:

Je vous ai mis en attach un fichier qui représente deux résultats de
blast. il s'agit d'un programme qui compare des séquence de caractères
et me dit si elles se ressemblent ou pas et avec quel pourcentage (score)

J'ai un fichier de 4000 résultats à la fois.
Je veux avec un petit scipt prélever que le meilleur résultat indiqués
par des étoiles.

Pour cela j'aimerai bien récupérer deux lignes pour chaque proposition
indiqué par des étoiles:

******1****** : c'est la séquence de mes données
*****2******; c'est la séquence qui ressemble à 1 avec le meilleur score
poposé par le programme blast en intérrogeant une base de données.

Je pense que grep faira l'affaire mais comment?

Merci beaucoup

Aidkom Mabrouk
















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Un texte encapsulé et encodé dans un jeu de caractères inconnu a été nettoyé...
Nom : exemple
URL : <https://lists.ubuntu.com/archives/ubuntu-tn/attachments/20080930/addce1e2/attachment.ksh>