Re: élimination du retour chariot dans un fichier texte

AtomCell shelhatem at gmail.com
Mar 30 Sep 02:16:26 BST 2008


bonjour,
etant donnée que la partie séquence de caractères n'est pas bien
caraterisé je te conseil d'utiliser un fichier batch ou un pg en c
plutot que vim
si tu ve un coup de main envoi moi en pv un fichier exemple je te
prépare un batch ou un c d'ici demain :)
aya bonne nuit

2008/9/29 kmezhoud <kmezhoud at mnhn.fr>:
> Salut Tout le monde,
>
> J'ai téléchargé le protéome d'une bactérie (c'est l'ensemble de
> protéines synthétisées par une bactérie) qui ce présente sous cette forme:
>
>>référence de la protéines avec son nom (retour à la ligne)
> BFKKSDLJSNBKFSKNFKSLKJSLFSLKJGLG (retour à la ligne)
> JHBSJBSQLKJBNSQNBGLKJSGKJNSDJKNGSDKJNGSDKNG: séquence de protéine
> .............................................................................
> (retour à la ligne)
>> référfence de la deuxième protéine (RETOUR À LA LIGNE)
> NLKJELCJH,JTG,ZIJCIORJGZCP,OCJ,ZOJRTZOBINUYNCHZVOH(retour à la ligne)
>
> .
> .
> .
>
>
> Je voudrais bien enlevé le retour à la ligne qui intérompe les séquences
> de protéine mais je voudrais bien garder celui des ligne commençant par
>> et celui qui finit la séquence càd avant le >.
>
> de tel sorte que j'aurai:
>
>>référence (retour à la ligne)
> séquence de caractères
>>références 2 ème protéine
> séquence de caractères
>>.......
>
> sous vim il parait qu'il y a la commane \n ou bien \p mais je ne sais
> pas plus.
>
>
>
> Auriez vous une idée?
>
> merci d'avance
>
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