Extraer varias lineas de texto

[Andrés Flórez]

Muchas gracias Raul,

lo intente pero el asunto es que me sale un error:

tr: si no se está truncando conjunto1, cadena2 debe ser no vacía

yo sinmebargo yo lo reemplacé por un caracter y funcion el comando tr



El día 26/10/07, Raul Veleiro A (en Yahoo) <raul_veleiro en yahoo.es> escribió:
>
>
> --- Andrés Flórez <andrewflorez en gmail.com> escribió:
>
> > Hola a todos:
> >
> > Tengo una dificultad para manipular archivos de
> > texto:
> >
> > Un archivo tiene varias lineas de la siguiente
> > forma:
> >
> > linea indicadora:
> >
> > >Nombre de la secuencia
> >
> > siguiente linea:
> >
> > cadena de caracteres.
> >
> > AKGKA ......
> >
> > Ejemplo:
> >
> > >LmjF02.0410|RNA-editing complex protein MP81,
> > putative
> >
> MHTAVLRQLSTPSTRPSGTANGGFGSSGVRDGSAPAPPSRGDGAATAPQQRSSHGVSSEL
> > >LmjF26.0390|RNA editing 3' terminal uridylyl
> > transferase 2,RET2, RNA
> > editing complex MP57
> >
> MHAPTPLYLYVAVTRGLCSSAVAASSSADAASSPSAASSSTSEGVSYASHLVASNDHYVQ
> >
> >
> > Necesito redireccionar a un archivo de texto  por
> > ejemplo la linea que dice
> > >LmjF02.0410|RNA     HASTA   EL FINAL DE LA CADENA
> > DE CARACTERES, MEJOR
> > DICHO HASTA ANTES DONDE EMPIEZA LA SIGUIENTE LINEA
> > CON EL SIGNO >
> >
> > En otras palabras necesito extraer un intervalo
> > desde una linea > con un
> > nombre hasta la proxima linea > con otro nombre
> >
> >
> > Les agradezco mucho cualquier ayuda.
> >
> >
> >
> > --
> > Andrés F. Flórez
> >
> > Associate Researcher
> > PECET.
> > Universidad de Antioquia.
> > Medellín-Colombia.
> > Carrera 53 # 61 - 30
> > Phones: (574) 210 6507 / 02
> > Fax: (574) 210 6511
> > Cell phone: 3103462268
> > > --
> > ubuntu-es mailing list
> > ubuntu-es en lists.ubuntu.com
> > https://lists.ubuntu.com/mailman/listinfo/ubuntu-es
>
> Aquí esta Andrés, no hace falta el bucle for que te
> mencione antes:
>
>
> cat p.txt | tr '\n' ' ' | awk 'BEGIN { RS = ">" ; FS =
> ">" } ; { print $1, $2 }'
>
> TRUCO: jugar con los RS (Record Separator) y FS (Field
> Separator) del AWK.
>
> El AWK es un lenguaje de progrmacion muy potente
> diseñado exclusimante para procesar ficheros de texto.
>
> Aqui esta el manual:
> http://www.gnu.org/software/gawk/manual/gawk.html
>
>
> Raul
>
> Solo hay 10 tipos de personas en el mundo;
> Los que entienden binario y los que no:
> Use Linux-Ubuntu !
> _o)
> /\\
> \_V
>
>
>
>
> ____________________________________________________________________________________
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> ¿Quieres saber cómo? ¡Deja que otras personas te ayuden!
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Andrés F. Flórez

Associate Researcher
PECET.
Universidad de Antioquia.
Medellín-Colombia.
Carrera 53 # 61 - 30
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