Extraer varias lineas de texto

Andrés Flórez andrewflorez en gmail.com
Vie Oct 26 15:21:07 BST 2007


Hola a todos:

Tengo una dificultad para manipular archivos de texto:

Un archivo tiene varias lineas de la siguiente forma:

linea indicadora:

>Nombre de la secuencia

siguiente linea:

cadena de caracteres.

AKGKA ......

Ejemplo:

>LmjF02.0410|RNA-editing complex protein MP81, putative
MHTAVLRQLSTPSTRPSGTANGGFGSSGVRDGSAPAPPSRGDGAATAPQQRSSHGVSSEL
>LmjF26.0390|RNA editing 3' terminal uridylyl transferase 2,RET2, RNA
editing complex MP57
MHAPTPLYLYVAVTRGLCSSAVAASSSADAASSPSAASSSTSEGVSYASHLVASNDHYVQ


Necesito redireccionar a un archivo de texto  por ejemplo la linea que dice
>LmjF02.0410|RNA     HASTA   EL FINAL DE LA CADENA DE CARACTERES, MEJOR
DICHO HASTA ANTES DONDE EMPIEZA LA SIGUIENTE LINEA  CON EL SIGNO >

En otras palabras necesito extraer un intervalo desde una linea > con un
nombre hasta la proxima linea > con otro nombre


Les agradezco mucho cualquier ayuda.



-- 
Andrés F. Flórez

Associate Researcher
PECET.
Universidad de Antioquia.
Medellín-Colombia.
Carrera 53 # 61 - 30
Phones: (574) 210 6507 / 02
Fax: (574) 210 6511
Cell phone: 3103462268
------------ próxima parte ------------
Se ha borrado un adjunto en formato HTML...
URL: https://lists.ubuntu.com/archives/ubuntu-es/attachments/20071026/b78eaa0d/attachment.htm 


Más información sobre la lista de distribución ubuntu-es