ImageJ launch bug

renaud nicolas rnd.nicolas at gmail.com
Tue Aug 16 11:25:34 UTC 2016


Dears,

There is a bug for launching imageJ in Ubuntu 16.04 LTS:

~$ imagej
Open other images in this ImageJ panel as follows:
  imagej -p 1 <image1> [<image2> ... <imageN>]

No JVM found to run ImageJ
Please apt-get install a JVM to run ImageJ or
set JAVA_HOME if it's not a JVM from a Debian Package.


update-java-alternatives -l
java-1.8.0-openjdk-amd64       1081
/usr/lib/jvm/java-1.8.0-openjdk-amd64


Please replace in /usr/bin/imagej

   JAVA_HOME=$(/usr/sbin/update-java-alternatives -l | grep openjdk | sort
| tail -1 | cut -d' ' -f 3)

by

 JAVA_HOME=$(/usr/sbin/update-java-alternatives -l | grep openjdk | sort |
tail -1 | tr -s ' ' | cut -d' ' -f 3)
Then imageJ launch correctly

as indicated in :

https://bugs.launchpad.net/ubuntu/+source/imagej/+bug/1556997

Thank you




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Renaud NICOLAS, Ph*.* D.*, *Post-doctoral Researcher
*Courriel : *rnd.nicolas at gmail.com ; renaud.nicolas at arcani.fr
<rnd.nicolas at gmail.com>
*Téléphone : *05 56 91 92 36 - 07 77 05 76 75
*Affiliations: *

*Aquitaine Institute for Cognitive and Integrative Neuroscience (INCIA),
UMR 5287, CNRS-Université Bordeaux 2, 33400 Talence, France.
*ResearchGate:* https://www.researchgate.net/profile/Renaud_Nicolas2
*ORCID: *orcid.org/0000-0001-5017-7718
*Page personnelle : *https://sites.google.com/site/renaudnicolasprofil/home

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