[Ubuntu-BR] [OFF-TOPIC] Ajuda com ataque de código criptografado no PHP!

[Henrique Fagundes]

Prezado Colegas,

Recorro a ajuda dos senhores, para resolver um problema que está me tirando o sono.

Possuo o seguinte cenário:
Servidor Linux com Apache, PHP e MySQL.

VERSÕES:
- Debian Stretch 9.9
- Apache 2.4.25
- PHP 7.0.33
- MysQL 5.7.26

Possuo alumas aplicações (entre elas um Drupal) na qual estão sob ataque. Estão conseguindo injetar uma espécie de código criptografado dentro dos arquivos PHP.
Eu excluo os arquivos, instalo as aplicações do zero, com o código limpo... Mas o código criptografado sempre volta.

Existe algum ajusto específico que eu possa fazer no "/etc/php/7.0/apache2/php.ini" para resolver esse problema?

Desabilitei essas funções:

disable_functions = pcntl_alarm,pcntl_fork,pcntl_waitpid,pcntl_wait,pcntl_wifexited,pcntl_wifstopped,pcntl_wifsignaled,pcntl_wifcontinued,pcntl_wexitstatus,pcntl_wtermsig,pcntl_wstopsig,pcntl_signal,pcntl_signal_dispatch,pcntl_get_last_error,pcntl_strerror,pcntl_sigprocmask,pcntl_sigwaitinfo,pcntl_sigtimedwait,pcntl_exec,pcntl_getpriority,pcntl_setpriority,show_source,system,shell_exec,passthru,exec,phpinfo,popen,proc_open,system,curl_exec,curl_multi_exec,parse_ini_file

Mesmo assim o problema persiste.
A ultima coisa que tentei foi "fechar" mais as permissões do apache.

O /var/www e seus subdiretórios estão com permissão 700 e os arquivos estão com 644.
Grupo e usuário é o www-data

Aviso que tenho conhecimento de Linux, mas nenhum conhecimento de PHP.

Existe algo que eu possa fazer?

Atenciosamente, 

Henrique Fagundes 
Analista de Suporte Linux 
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